信息概要
鲸类环境DNA（eDNA）宏条形码分析是一种通过采集水体、沉积物等环境样本中的游离DNA，结合高通量测序技术，快速、非侵入性地监测鲸类物种分布和多样性的先进方法。该技术具有高灵敏度、低成本和对生物无干扰等优势，适用于濒危鲸类保护、生态评估及生物多样性研究。检测的重要性在于为鲸类种群动态、栖息地保护及海洋生态系统健康评估提供科学依据，助力全球鲸类保护行动。
检测项目
物种鉴定, 遗传多样性分析, 种群结构评估, 相对丰度计算, 稀有物种检测, 群落组成分析, 系统发育关系, 功能基因筛查, 环境适应性基因检测, 病原体筛查, 污染物影响评估, 迁徙路径追踪, 性别鉴定, 个体识别, 食性分析, 共生微生物检测, 环境压力响应基因, 表观遗传标记, 杂交事件检测, 历史种群动态
检测范围
须鲸科, 抹香鲸科, 喙鲸科, 海豚科, 鼠海豚科, 独角鲸科, 小抹香鲸科, 领航鲸属, 虎鲸属, 露脊鲸属, 灰鲸属, 座头鲸属, 蓝鲸属, 长须鲸属, 塞鲸属, 布氏鲸属, 大翅鲸属, 南露脊鲸属, 北露脊鲸属, 伊河海豚属
检测方法
eDNA采样过滤法：使用特定孔径滤膜捕获环境中的DNA片段
CTAB法：传统DNA提取方法，适用于复杂环境样本
磁珠纯化法：高效吸附核酸，去除环境抑制剂
PCR扩增：针对鲸类特异性条形码区域（如12S rRNA、COI基因）进行扩增
巢式PCR：提高低浓度eDNA的检测灵敏度
定量PCR（qPCR）：绝对定量目标物种DNA含量
数字PCR（dPCR）：超高灵敏度绝对定量技术
Illumina测序：高通量平行测序获取宏条形码数据
Oxford Nanopore测序：长读长实时测序技术
生物信息学聚类：基于序列相似度划分操作分类单元（OTU）
ASV分析：使用Amplicon Sequence Variants提高分辨率
BLAST比对：与NCBI等数据库进行物种注释
机器学习分类：利用算法提高物种鉴定准确性
α/β多样性分析：评估样本内和样本间多样性差异
网络分析：揭示物种共现模式和生态关联
检测仪器
离心机, 超微量分光光度计, PCR仪, 电泳系统, 凝胶成像仪, 磁力架, 核酸提取仪, 高通量测序仪, 荧光定量PCR仪, 数字PCR系统, 纳米孔测序仪, 生物分析仪, 超纯水系统, 冷冻离心机, 恒温混匀仪
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